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●概要●
同じセル内に同じ文字列が存在する場合、置換機能では、すべての文字列が置換の対象となりますが、文字列操作関数を使うと、置換対象となる文字列の位置を指定し、置換を実行することができます。

●詳細●
置換後の文字列を表示するセルを選択します。
選択したセルに、
=SUBSTITUTE(文字列,検索文字列,置換文字列,置換対象)
という数式を入力します。
（例）セルA1に入力されている“1-1-1-001”を“1-1-a-001”にしたい場合、セルA1に含まれる“1”のうち、“3番目の1”を“a”にするという式になりますので、数式は、以下のようになります。
=SUBSTITUTE(A1,1,"a",3)　という数式を入力します。

●補足●
数式中で置換対象を省略した場合は、文字列中のすべての検索文字列が置換の対象となります。